Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm17577J3QNF7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm17577J3QNF7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm17577J3QNF7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm17577J3QNF7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm17577J3QNF7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm17577J3QNF7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm17577J3QNF7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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