Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c3J3QJW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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