Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf148G3X9R7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf148G3X9R7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf148G3X9R7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf148G3X9R7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rnf148G3X9R7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf148G3X9R7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf148G3X9R7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf148G3X9R7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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