Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nccrp1G3X9C2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms