Protein–RNA interactions for Protein: F6R3J9

Gm8879, Predicted gene 8879, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8879F6R3J9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8879F6R3J9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms