Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930451I11RikE9Q9R3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms