Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc146E9Q9F7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms