Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pgbd1E9Q492 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pgbd1E9Q492 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms