Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ccdc171E9Q1U1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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