Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms