Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Brd1E9PZ26 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms