Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp54bE9PXC0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms