Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms