Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms