Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3543D3Z235 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm3543D3Z235 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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