Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lce6aD3YV94 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lce6aD3YV94 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms