Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc13D3YV10 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms