Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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