Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apol6B7ZC55 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apol6B7ZC55 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms