Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms