Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cspp1B2RX88 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms