Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms