Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt4B2RU40 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms