Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms