Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf3B2KF05 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms