Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms