Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930435E12RikA6X8Z9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms