Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3173A6NAS3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms