Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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