Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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