Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syndig1A2ANU3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms