Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc4a11A2AJN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms