Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Frmpd4A2AFR3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms