Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms