Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc173A0JLY1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc173A0JLY1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms