Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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