Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms