Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLE1Q9NVX2 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLE1Q9NVX2 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms