Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SP6Q3SY56 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms