Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms