Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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