Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ATP2B3Q16720 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms