Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
UBE3CQ15386 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
UBE3CQ15386 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms