Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms