Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RFTN1Q14699 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms