Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAT1Q14517 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAT1Q14517 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms