Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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COL4A6Q14031 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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COL4A6Q14031 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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COL4A6Q14031 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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COL4A6Q14031 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
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COL4A6Q14031 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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COL4A6Q14031 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
COL4A6Q14031 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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