Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
APOFQ13790 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
APOFQ13790 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
APOFQ13790 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
APOFQ13790 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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APOFQ13790 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
APOFQ13790 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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