Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SKP2Q13309 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms