Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CRXO43186 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CRXO43186 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms